XANA est un « programme multi-agent », une intelligence artificielle conçue par Franz Hopper, le créateur de Lyoko. Sa fonction initiale était de contrer un projet militaire secret, le projet Carthage. Mais, pour une raison qui demeure obscure, XANA a échappé au contrôle de son créateur est s’est retourné contre lui. Plusieurs hypothèses explicatives peuvent être formulée à ce sujet :
- Il a été victime d’un bug ou d’un virus.
- Il a simplement cherché à se défendre (cette fonction devant être intégré à son IA), et a considéré Hopper comme un ennemi après que celui-ci, se sentant espionné, a voulu détruire ses travaux, XANA compris. Il aurait ensuite considéré Jérémie, Odd, Yumi et Ulrich comme ses ennemis selon le principe « les amis de mes ennemis sont mes ennemis ».
- Il a poussé jusqu’au bout la logique de sa programmation, et a estimé que le meilleur moyen de préserver le monde contre le projet Carthage était de… dominer lui-même le monde.
- Il s’est imprégné d’un esprit sans vergogne (par exemple celui d’un homme en noir).
D’autre part, les 2546 retours vers le passé effectués par Hopper ont probablement contribué à ce que XANA se comporte comme une sorte de virus, son programme initial n'étant pas conçu pour évoluer autant. Il n’est pas coextensif avec l’ordinateur quantique, l’une des nombreuses preuves étant qu’il n’a pas accès à certaines zones de la mémoire de la machine, ou encore qu’il doive pirater des tours pour attaquer sur Terre. Il n’en reste pas moins que XANA demeure, du moins dans les deux premières saisons, tributaire de la puissance de calcul de l’ordinateur quantique. Avec les nombreux retours vers le passé de Franz Hopper (2546 !) plus ceux de Jérémie, XANA a atteint un niveau de complexité n’ayant plus rien à voir avec sa programmation initiale